2018年我市印发了《宣城市地表水断面生态补偿暂行办法》（以下简称《办法》），建立了全市地表水断面生态补偿机制。该《办法》由市生态环境局根据补偿断面水质监测数据，核算各地生态补偿和污染赔付资金，市财政局负责年终结算。“十三五”期间，全市累计获得生态补偿资金9100万元，产生污染赔付资金4800万元，净获得省级补偿资金4300万元。该机制以经济杠杆撬动水污染防治更上台阶，有力促进了各地加强水污染防治和水质断面目标管控工作，有效改善了全市地表水环境质量。全市国控断面水质优良比例由2017年的71.4%提升到2020年的85.7%，水质达标率100%。

“十四五”期间，我市国控、省控、市控地表水断面由“十三五”的32个增加到38个，在全面总结、广泛调研基础上，市生态环境局、财政局对现有的《办法》进行了进一步修订完善，并征求各县（市、区）及市经开区意见，形成《宣城市地表水断面生态补偿办法》。此次《办法》的修订进一步完善了水生态补偿工作机制：一是进一步完善了补偿断面。将16个国控断面全部纳入补偿范围，调整跨县（市、区）、市经开区边界的7个省控、市控断面；二是进一步完善污染赔付因子。结合现状实际，新增化学需氧量污染赔付因子；三是进一步优化补偿方式。坚持好水补偿原则，对于水质目标为Ⅱ类的断面，其年度实际水质类别不低于Ⅲ类，均可获得补偿；四是进一步优化核算方式。采取月度补偿与年度奖励相结合的补偿核算方式。